— в апелляционном порядке дела по жалобам и представлениям на решения, приговоры, определения и постановления гарнизонных военных судов, принятые ими в первой инстанции и не вступившие в законную силу;
— в кассационном порядке дела по жалобам и представлениям на решения, приговоры, определения и постановления гарнизонных военных судов, вступившие в законную силу, а также на решения, приговоры, определения и постановления, принятые окружным (флотским) военным судом в апелляционном порядке;
— дела по новым и вновь открывшимся обстоятельствам в отношении вступивших в законную силу приговоров, определений и постановлений гарнизонных военных судов.
Надзор за судебной деятельностью военных судов осуществляет Судебная коллегия по делам военнослужащих Верховного Суда РФ, которая является непосредственно вышестоящей судебной инстанцией по отношению к окружным (флотским) военным судам.
Судебная коллегия по делам военнослужащих Верховного Суда РФ формируется в составе заместителя Председателя Верховного Суда РФ — председателя Судебной коллегии по делам военнослужащих ВС РФ и судей этой коллегии.
Судебная коллегия по делам военнослужащих Верховного Суда РФ рассматривает (ст. 9 Закона о военных судах):
— в первой инстанции — дела об оспаривании нормативных и ненормативных правовых актов Президента РФ, Правительства РФ, Министерства обороны РФ, иных федеральных органов исполнительной власти, в которых федеральным законом предусмотрена военная служба, касающихся прав, свобод и охраняемых законом интересов военнослужащих, граждан, проходящих военные сборы; дела по заявлениям о присуждении компенсации за нарушение права на судопроизводство в разумный срок или права на исполнение судебного акта в разумный срок по делам, подсудным окружным (флотским) военным судам;
— в апелляционной инстанции — дела по жалобам и представлениям на решения, приговоры, определения и постановления окружных (флотских) военных судов, принятые ими в первой инстанции и не вступившие в законную силу;
— в кассационной инстанции — дела по жалобам и представлениям на вступившие в законную силу решения, приговоры, определения, постановления гарнизонных военных судов и на определения окружных (флотских) военных судов, если они обжаловались в кассационном порядке в президиумы окружных (флотских) военных судов;
— дела по новым и вновь открывшимся обстоятельствам в отношении вступивших в законную силу приговоров, определений и постановлений окружных (флотских) военных судов.
Военные суды рассматривают не только уголовные дела (как это было предусмотрено ранее действовавшим Положением о военных трибуналах), но и определенные категории гражданских и административных дел, поэтому следует разграничивать компетенцию по рассмотрению гражданских, административных и уголовных дел между военными судами и другими судами общей юрисдикции, а также между самими военными судами. Правила о подсудности дел военным судам сформулированы в Законе о военных судах.
Основной критерий для определения подсудности дел военным судам: